Docking@Home

Docking@Home

Grafik fra klientsoftware
Type Distribueret computing
Operativ system Cross-platform software
Hardware platform x86
nyeste version • Charmm 34a2: 6,23
Stat Lukker 23.05.2014
Internet side docking.cis.udel.edu
 Mediefiler på Wikimedia Commons
Docking@Home
Platform BOINC
Software download størrelse 7,7 MB
Jobdata indlæst størrelse 1,2 MB
Mængden af ​​sendt jobdata 75-100 KB
Diskplads _ 11 MB
Brugt mængde hukommelse 169 MB
GUI der er
Gennemsnitlig opgaveberegningstid 5,5 timer
deadline 14 dage
Mulighed for at bruge GPU Ingen
 Mediefiler på Wikimedia Commons

Docking@Home  er et frivilligt computerprojekt drevet af BOINC-platformen . Projektet er vært ved University of Delaware . Hovedformålet med projektet er at modellere interaktionen mellem potentielle lægemidler og proteiner ( docking ). [1] Den 7. april meddelte Docking@Home-ledelsen, at projektet blev lukket den 23. maj 2014. [2]

Docking

Molekylær docking er en søgning efter ligand-proteinkomplekser, der har et minimum af fri energi , det vil sige dem, hvis komponenter "passer" til hinanden på en optimal måde. Søgningen efter sådanne komplekser er en opgave, der er godt paralleliseret og derfor egnet til distribueret databehandling. [3] I Docking@Home-projektet udføres modelleringen af ​​ligandbinding til proteinbindingsstedet ved hjælp af CHARMM -softwaremodulet . Processen består af flere uafhængige forsøg med forskellig rumlig orientering og ligandkonformation . [en]

Projektdetaljer og statistik

Videnskabelige resultater

Noter

  1. 1 2 http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=4228396 Arkiveret 27. marts 2014 på Wayback Machine pdf Arkiveret 10. juni 2010 på Wayback Machine
  2. Nyheder om projektlukning Arkiveret 17. oktober 2014.
  3. Stephen Childs; Luc Bouge; Martti Forsell; Traf, Jesper; Achim Street; Ziegler, Wolfgang; Alexander, Michael Van Cleave. Euro-Par 2007 Workshops: Parallel behandling: HPPC 2007, UNICORE Summit 2007 og VHPC 2007, Rennes, Frankrig, 28.-31. august 2007, Revided Selected Papers (Lecture Notes in Computer Science  ) . - Berlin: Springer, 2008. - S. 85. - ISBN 3-540-78472-1 .

Se også

Links