Dicer

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 16. april 2018; checks kræver 3 redigeringer .
Dicer 1, ribonuklease III

Struktur af RNase IIIb og mus dsRNA-bindende domæne (Dicer).
Tilgængelige strukturer
FBF Ortholog søgning: PDBe , RCSB
Identifikatorer
SymbolDICER1  ; DCR1; Dicer; HERNA; MNG1; RMSE2
Eksterne ID'erOMIM:  606241 MGI :  2177178 HomoloGene :  13251 GeneCards : DICER1 Gene
EF-nummer3.1.26.3
ortologer
UdsigtHumanMus
Entrez23405192119
EnsembleENSG00000100697ENSMUSG00000041415
UniProtQ9UPY3Q8R418
RefSeq (mRNA)NM_001195573NM_148948
RefSeq (protein)NP_001182502NP_683750
Locus (UCSC)Chr 14:
95,55 – 95,62 Mb
Chr 12:
104,69 – 104,75 Mb
Søg i PubMed[en][2]

Dicer  er en ribonuklease fra RNase III (RNase III) familien, der skærer dobbeltstrengede RNA og pre-miRNA molekyler (premiRNA ) for at producere korte dobbeltstrengede RNA fragmenter kaldet henholdsvis lille interfererende RNA (siRNA) og miRNA (miRNA). Disse fragmenter er ca. 20-25 nukleotider lange , typisk med et udhæng på 2-3 nukleotider i 3'-enden [1] .

Dicer indeholder to RNase III-domæner og et PAZ-domæne . Afstanden mellem disse områder i molekylet bestemmes af længden og vinklen af ​​forbindelsesløkken og bestemmer længden af ​​det resulterende siRNA. Dicer katalyserer det første trin i RNA-interferensprocessen og initierer dannelsen af ​​RISC (RNA-induceret silencing complex), hvis katalytiske komponent, Argonaute -proteinet , er en endonuklease, der nedbryder mRNA'er komplementære til siRNA-ledende streng [2] .

Se også

Noter

  1. 1 2 Macrae I., Zhou K., Li F., Repic A., Brooks A., Cande W., Adams P., Doudna J.  Strukturelt //grundlag for dobbeltstrenget RNA-behandling af Dicer - 2006. - Bd. 311 , nr. 5758 . - S. 195-198 . - doi : 10.1126/science.1121638 . — PMID 16410517 .
  2. Jaronczyk K., Carmichael J., Hobman T. Udforskning af funktionerne af RNA-interferens-pathway-proteiner: nogle funktioner er mere RISCy end andre?  (eng.)  // Biochem J : journal. - 2005. - Bd. 387 , nr. Pt 3 . - s. 561-571 . - doi : 10.1042/BJ20041822 . — PMID 15845026 .