Avsunviroidae

Avsunviroidae
videnskabelig klassifikation
Gruppe:Virus [2]Gruppe:Viroider [1]Familie:Avsunviroidae
Internationalt videnskabeligt navn
Avsunviroidae

Avsunviroidae  (lat.)  er en familie af viroider . Indtil videre kendes tre repræsentanter. De består af et RNA- molekyle , der udgør viroidgenomet , 246-375 nukleotider langt . De er repræsenteret af et enkeltstrenget cirkulært RNA-molekyle og har intramolekylære parrede baser. Alle repræsentanter mangler en uændret central side.

Replikering

Replikation sker i kloroplasterne i planteceller . Nøgletræk ved replikation hos repræsentanter for denne familie er fraværet af behovet for en hjælpervirus såvel som fraværet af proteinkodning . I modsætning til en anden familie af viroider, Pospiviroidae , følger replikation i Avsunviroidae en symmetrisk repetitiv mekanisme. De positive strenge af RNA menes at fungere som skabelon for dannelsen af ​​negative strenge af et enzym svarende til RNA-polymerase II. Den negative streng af RNA spaltes derefter med et ribozym . I den anden gentagelse af mekanismen dannes en positiv streng, som også spaltes af ribozymet, og derefter fastgøres og bliver cirkulær. Den nøjagtige placering, hvor replikation finder sted, er ikke kendt, men det menes at forekomme i kloroplaster i nærværelse af magnesiumioner .

Struktur

Viroiderne i denne familie menes at eksistere som stavformede molekyler med baseparrede områder, hvor de danner stiftlignende strukturer eller har forgrenede konfigurationer.

Klassifikation

Ifølge International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) omfatter Avsunviroidae- familien i maj 2016 3 slægter [3] :

Noter

  1. ↑ Fra 1998 er Viroids ikke et gyldigt taxon under ICTV , men bruges af det som et fællesnavn for en gruppe af subvirale partikler [klausuler 3.26 og 3.27 i International Code of Classification and Nomenclature of Viruses  (engelsk) ].
  2. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  3. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Få adgang: 15. juli 2016) .

Links