Cellulosesyntase (UDP-glukose-brugende)

Cellulosesyntase

Struktur af bakteriel cellulosesyntase
Identifikatorer
Kode KF 2.4.1.12
CAS nummer 9027-19-4
Enzymdatabaser
IntEnz IntEnz visning
BRENDA BRENDA indgang
ExPASy NiceZyme udsigt
MetaCyc metabolisk vej
KEGG KEGG indgang
PRIAM profil
FBF strukturer RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Søg
PMC artikler
PubMed artikler
NCBI NCBI proteiner
CAS 9027-19-4

I enzymologi er  cellulosesyntase  ( EC-kode 2.4.1.12 , UDP - glucose:(1→4)-β - d -glucan-4-β- d - glycosyltransferase ) et enzym , der katalyserer en kemisk reaktion :

UDP-glucose + [(1→4)-β-D-glucopyranosyl] n  = UDP + [(1→4)-β-D-glucopyranosyl] n+1

Substraterne af dette enzym er således UDP-glucose og [(1→4)-β-D-glucopyranosyl] n , og produkterne er UDP og [( 1→4)-β- D -glucopyranosyl ] n+1 .

Enzymet er involveret i syntesen af ​​cellulose . Et beslægtet enzym, der anvender GDP-glucose som et substrat, er cellulosesyntase (GDP-glucoseafhængig) (EC 2.4.1.29).

Cellulose

Cellulosefibriller  er en samling af uforgrenede  polymerkæder  af β-(1→4)-bundne  glucoserester  . Cellulose udgør en betydelig del af de primære og sekundære cellevægge i grønne planter . [1] [2] [3] [4]  Selvom dette enzym er essentielt for at opbygge jordplanters cellevæg , findes det også i alger , nogle bakterier og en række dyr . [5] [6] [7] [8] Verden producerer 2 × 10 11 tons cellulosemikrofibriller. [9]  Cellulose er grundlaget for produktionen af ​​vedvarende biobrændstoffer og andre materialer af vegetabilsk oprindelse (tømmer, forskellige brændstoffer, vegetabilsk foder, papir og bomuld og andre fibre ). [ti]

Funktioner af cellulose

Mikrofibriller syntetiseres på overfladen af ​​cellemembraner for at styrke cellevæggene, hvilket er blevet grundigt undersøgt af plantebiokemikere og cellebiologer, fordi 1) de regulerer cellemorfogenesen og 2) de udfører i cellevæggen sammen med mange andre komponenter (f.eks. lignin ) , hemicellulose , pektiner ) essentiel støtte til dens struktur og form af cellen. Uden disse bærende strukturer ville cellevækst tvinge dem til at udvide sig i alle retninger og derved miste deres form  [11]

Struktur af cellulosesyntase

Plantecellulosesyntaser tilhører familien af ​​glycosyltransferaser , som er proteiner involveret i biosyntesen og hydrolyse af meget af jordens biomasse. [12] Cellulose syntetiseres ved hjælp af store cellulosesyntasekomplekser (CSC'er), som består af syntaseisoformer ( CesA  ) kombineret i en unik hexagonal struktur kendt som "rosettekomplekset", 50 nm bredt og 30-35 nm højt. [13] [14] Der er over 20 sådanne lange  integrerede membranproteiner , hver omkring 1000 aminosyrer store . Disse rosetkomplekser, tidligere kaldet granuler, blev først opdaget i 1972 ved hjælp af elektronmikroskopi i grønalgearterne Cladophora  og Chaetomorph [15] (Robinson et al. 1972). Røntgendiffraktionsanalysen viste, at CesAs er placeret på overfladen af ​​plantecellen og er aflange monomerer med to katalytiske domæner , der kombineres til dimerer . Den centrale del af dimerer er et katalytisk aktivt sted. Fordi cellulose syntetiseres i alle cellevægge, er CesA-proteiner til stede i alle plantevæv og celletyper. Der er dog forskellige typer af CesA, og forskellige vævstyper kan variere i deres koncentrationsforhold. For eksempel er AtCesA1 (RSW1)-proteinet involveret i primær cellevægsbiosyntese i hele planten, AtCesA7 (IRX3)-proteinet udtrykkes kun i stammen til sekundær cellevægssyntese. [16]

Cellulosesyntaseaktivitet

Cellulosebiosyntese er en proces, hvor individuelle homogene β-(1→4)-glucankæder, fra 2.000 til 25.000 glukoserester i længden, syntetiseres og derefter straks danner hydrogenbindinger med hinanden, og danner faste krystallinske formationer - mikrofibriller. Mikrofibrillerne i den primære cellevæg er cirka 36 kæder lange, mens mikrofibrillerne i den sekundære cellevæg er meget større og indeholder op til 1200 β-(1→4)-glucankæder. UDP-glucose, som syntetiseres af enzymet saccharosesyntase, som producerer og transporterer UDP-glucose til plasmamembranen  , er det substrat, som cellulosesyntase bruger til at opbygge glucankæden. [17]  Den hastighed, hvormed glucoserester syntetiseres for en enkelt glucankæde, varierer fra 300 til 1000 glucoserester pr. minut, hvor den højere hastighed er mere almindelig i sekundære cellevægge såsom xylem. [18] [19]

Reaktion ved hjælp af UDP-glucose

I enzymologi er  cellulosesyntase (UDP-glucose- brugende) ( EF-kode 2.4.1.12 ) et enzym , der katalyserer en kemisk reaktion

UDP-glucose + [(1 →4)-β- D -glucopyranosyl ] n UDP + [(1→4)-β-D-glucopyranosyl] n+1

Således er de to substrater af dette enzym UDP-glucose og en kæde af (1→4)-β-D-glucopyranosylrester, mens dets to produkter er UDP og en forlænget kæde af glucopyranosylrester. Glucopyranosyl er pyranoseformen  af ​​glucose , kæden af ​​(1→4)-β -D- glucopyranosylrester er  cellulose , og derfor spiller enzymer af denne klasse en vigtig rolle i cellulosesyntese.

Dette enzym tilhører familien af ​​hexosyltransferaser, mere specifikt til  glycosyltransferaserne . Det systematiske navn for denne klasse af enzymer er UDP-glucose: 1,4-β- D - glucan 4-β- D - glucosyltransferase. Andre almindelige navne:  UDP-glucose-β-glucan glucosyltransferase , UDP-glucose-cellulose glucosyltransferase , GS-I , β-(1→4)-glucosyltransferase , uridin diphosphoglucose-(1→4)-β-glucan glucosyl , β -transferase glucosyl (1→4)-glucansyntase , β-(1→4)-glucansyntase , β-glucansyntase , (1→4)-β - D -glucansyntase , (1→4)-β-glucan- syntase , glucansyntase , UDP-glucose-(1→4)-β-glucan glucosyltransferase og uridin diphosphoglucose-cellulose glucosyltransferase .

Støttestrukturer

Syntese af mikrofibriller er drevet af kortikale  mikrotubuli , der ligger under plasmamembranen af ​​forlængende celler, som giver en platform, hvorpå CTC'er kan omdanne glukose til krystallignende kæder. Den co-lineære hypotese om mikrotubuli og mikrofibriller tyder på, at kortikale mikrotubuli, der ligger under plasmamembranen af ​​forlængende celler, giver veje til CTC'er, der omdanner glukosemolekyler til krystallignende cellulosemikrofibriller. [20]  Den "direkte" hypotese antyder, at der er nogle typer direkte forbindelser mellem CesA-komplekser og mikrotubuli. Derudover betragtes KORRIGAN-proteinet (KOR1) som en væsentlig bestanddel af cellulosesyntese, da det virker på cellulose mellem plasmamembranen og cellevæggen. KOR1 interagerer med to specifikke CesA-proteiner, hvilket muligvis korrigerer og lindrer stress fra glucankædesyntese ved at hydrolysere uordnet amorf cellulose. [21]

Miljøpåvirkninger

Cellulosesyntaseaktivitet påvirkes af mange miljøfaktorer såsom hormoner, lys, mekaniske stimuli, ernæring og interaktioner med cytoskelettet . Interaktionen mellem disse faktorer kan påvirke aflejringen af ​​cellulose ved at ændre mængden af ​​dannet substrat og koncentrationen og/eller aktiviteten af ​​CTC'er i plasmamembranen.

Links

  1. Cutler, S. Klassifikation af nukleotid-diphospho-sukker glycosyltransferaser baseret på aminosyresekvens ligheder  //  Biochemistry: journal. - 1997. - Bd. 326 . - S. 929-939 . doi : 10.1042 / bj3260929u . — PMID 9334165 .
  2. Olek, Rayon, Wakowski, Kim, Badger, Ghosh, Crowley, Himmel, Bolin, Carpita, AT, C., LHR, P., J., LN, S., D., M., ME, NC Strukturen af det katalytiske domæne af en plantecellulosesyntase og dens samling til dimerer  (engelsk)  // The Plant Cell  : journal. - 2014. - Bd. 26 . - S. 2996-3009 . - doi : 10.1105/tpc.114.126862 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  3. Richmond, Todd. Højere plantecellulosesyntase  //  BioMed Central. - 2000. - Vol. 1 . — S. 3001 . - doi : 10.1186/gb-2000-1-4-reviews3001 .
  4. Lei, Li, Gu, L., S., Y. Cellulosesyntasekomplekser: sammensætning og regulering  //  Frontiers of Plant Science: journal. - 2012. - Bd. 3 . - S. 75 . - doi : 10.3389/fpls.2012.00075 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  5. Nakashima, Yamada, Satou, Azuma, Satoh, K., L., Y., J., N. Den evolutionære oprindelse af animalsk cellulosesyntase  //  Development Genes and Evolution : journal. - 2004. - Bd. 214 . - S. 81-88 . - doi : 10.1007/s00427-003-0379-8 . — PMID 14740209 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  6. Yin, Huang, Xu, Y., J., Y. Cellulosesyntase-superfamilien i fuldt sekventerede planter og alger  //  BMC Plant Biology : journal. - 2009. - Bd. 9 . — S. 99 . - doi : 10.1186/1471-2229-9-99 . — PMID 19646250 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  7. Sethaphong, Haigler, Kubicki, Zimmer, Bonetta, DeBolt, Yinling, L., CH, JD, J., D S., IG  Tertiær model af en plantecellulosesyntase  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - 2013. - Bd. 110 . - P. 7512-7517 . - doi : 10.1073/pnas.1301027110 . — PMID 23592721 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  8. Li, Lei, Gu, S., L., Y. Funktionel analyse af komplekser med blandede primære og sekundære cellulosesyntaser  //  Plant Signaling and Behavior : journal. - 2012. - Bd. 8 . — S. 23179 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  9. Lieth, H. Måling af brændværdier. Biosfærens  primære produktivitet . - New York: Springer, 1975. - S. 119-129.
  10. Cutler, Somerville, S., C. Cellulosesynthesis: Cloning in silico  // Current Biology  : journal  . - Cell Press , 1997. - Vol. 7 . - S. 108-111 . - doi : 10.1016/S0960-9822(06)00050-9 .
  11. Hogetsu, Shibaoka, T., H. Effekter af colchicin på celleform og på mikrofibrillers arrangement i cellevæggen af ​​Closterium acerosum  //  Planta: journal. - 1978. - Bd. 140 . - S. 445-449 . - doi : 10.1007/BF00389374 . — PMID 24414355 .
  12. Campell, Davies, Bulone, Henrissat, JA, GJ, V., B.A .. Klassificering af nukleotid-diphospho-sukker glycosyltransferaser baseret på aminosyresekvens ligheder  // Biochemical  Journal : journal. - 1997. - Bd. 329 . — S. 719 . — PMID 9445404 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  13. Giddings, Brower, Staehelin, TH, DL, LA dannelse af cellulosefibriller i primære og sekundære vægge  //  Journal of Cellular Biology: tidsskrift. - 1980. - Bd. 84 . - s. 327-339 . - doi : 10.1083/jcb.84.2.327 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  14. Bowling, Brown, AJ, RM Jr. Det cytoplasmatiske domæne af det cellulosesyntetiserende kompleks i karplanter  (engelsk)  // Protoplasma : journal. - 2008. - Bd. 233 . - S. 115-127 . - doi : 10.1007/s00709-008-0302-2 .
  15. Robinson, White, Preston, DG, RK, RD Fin struktur af sværmere af Cladophora og Chaetomorpha. III. Vægsyntese og -udvikling  (engelsk)  // Planta : journal. - 1972. - Bd. 107 . - P. 7512-7517 . - doi : 10.1007/BF00387719 . — PMID 24477398 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  16. Richmond, T. Højere plantecellulosesyntase  //  BioMed Central. - 2000. - Vol. 7 . — S. 3001 . - doi : 10.1186/gb-2000-1-4-reviews3001 .
  17. Heath, IB En samlet hypotese for rollen af ​​membranbundne enzymkomplekser og mikrotubuli i plantecellevægssyntese  //  Journal of Theoretical Biology : journal. - 1974. - Bd. 48 . - S. 445-449 . - doi : 10.1016/S0022-5193(74)80011-1 .
  18. Paredez, Somerville, Ehrhardt, AR, CR, DW Visualisering af cellulosesyntase demonstrerer funktionel sammenhæng med mikrotubuli  //  Science : journal. - 2006. - Bd. 312 . - S. 1491-1495 . - doi : 10.1126/science.1126551 . — PMID 16627697 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )
  19. Wightman, Turner, R., S. R. Cytoskelettets roller under celluloseaflejring ved den sekundære cellevæg  //  The Plant Journal : journal. - 2008. - Bd. 54 . - S. 794-805 . - doi : 10.1111/j.1365-313X.2008.03444.x . — PMID 18266917 .
  20. Green, PB Mechanism for plant cellular morfogenesis   // Videnskab . - 1962. - Bd. 138 . - S. 1404-1405 . - doi : 10.1126/science.138.3548.1404 .
  21. Mansoori, Timmers, Desprez, Kamei, Dees, Vinken, Viiser, Hoefte, Venhettes, Trindade, N., J., T., CLA, DCT, JP, RGF, H., S., LM KORRIGAN1 interagerer specifikt med integral komponenter i cellulosesyntasemaskineriet  (engelsk)  // PLoS ONE  : journal. - 2014. - Bd. 9 . — P. e112387 . - doi : 10.1371/journal.pone.0112387 . CS1 vedligeholdelse: Flere navne: forfatterliste ( link )