Plastocyanin familie af kobberbindende proteiner

Plastocyanin/azurin-familien af ​​kobberbindende proteiner (eller type 1 blåt proteindomæne)  er en familie af små proteiner, der er i stand til at binde et enkelt kobberatom og er karakteriseret ved en stærk absorption, der topper omkring 600 nm, på grund af hvilken, i reduceret tilstand, de er normalt farvet lyse blå (se kobberholdige proteiner) proteiner ) [2] [3] . De bedst kendte medlemmer af denne klasse af proteiner er planteplastocyaninerne , små vandopløselige kloroplastproteiner, der overfører en elektron fra cytochrom f og er fjernt beslægtet med bakterieproteinerne azuriner , som udveksler elektroner med cytochrom c551. Denne familie omfatter også proteinet amycyanin fra bakterier såsom Methylobacterium extorquens eller Paracoccus versutus ( Thiobacillus versutus ), der kan vokse på methylamin ; auracyanin A og B fra Chloroflexus aurantiacus ; [4] blåt kobberprotein fra Alcaligenes faecalis ; cupredoxin fra skrælning af Cucumis sativus (agurk); [5] Cusacyanin (grundlæggende blå protein) fra agurk; halocyanin, et membranbundet protein fra Natronomonas pharaonis ( Natronobacterium pharaonis ), [6] pseudoazurin fra Pseudomonas ; rusticyanin fra Thiobacillus ferrooxidans ; [7] stellacyanin fra Rhus vernicifera (japansk laktræ); umecyanin fra rødderne af Armoracia rusticana (peberrod); og Ra3-allergen fra ragweed . Dette pollenprotein er evolutionært tæt på polypeptiderne anført ovenfor, men ser ud til at have mistet evnen til at binde kobber. Selvom der er markant divergens i den primære struktur af alle disse proteiner, forbliver kobberbindingsstedet meget konserveret.

Noter

1. ↑ Guss JM, Bartunik HD, Freeman HC . Nøjagtighed og præcision i proteinstrukturanalyse: begrænset mindste kvadraters forfining af strukturen af ​​poppelplastocyanin ved 1,33 A opløsning   // Acta Cryst . B : journal. - International Union of Crystallography , 1992. - December ( vol. 48 , nr. 6 ). - S. 790-811 . - doi : 10.1107/S0108768192004270 . — PMID 1492962 .
2. ↑ Clingeleffer DJ, Guss JM, Rogers SJ, Freeman HC, Garrett TP Krystalstrukturen af ​​poppel apoplastocyanin ved 1,8-A opløsning. Kobberbindingsstedets geometri er skabt af polypeptidet  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 1984. - Bd. 259 , nr. 5 . - S. 2822-2825 . — PMID 6698995 .
3. ↑ Hunt LT, Ryden LG Udvikling af proteinkompleksitet: de blå kobberholdige oxidaser og beslægtede proteiner  //  J. Mol. Evol. : journal. - 1993. - Bd. 36 , nr. 1 . - S. 41-66 . - doi : 10.1007/BF02407305 . — PMID 8433378 .
4. ↑ Meyer TE, Han J., McManus JD, Brune DC, Sanders-Loehr J., Cusanovich MA, Tollin G., Blankenship RE Isolering, karakterisering og aminosyresekvenser af auracyaniner, blå kobberproteiner fra den grønne fotosyntetiske bakterie Chloroflexus aurantiacus  (engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. - 1992. - Bd. 267 , nr. 10 . - P. 6531-6540 . — PMID 1313011 .
5. ↑ Messerschmidt A., Mann K., Thoenes U., Mehrabian Z., Nalbandyan R., Schafer W. Aminosyresekvensen af ​​et type I kobberprotein med et usædvanligt serin- og hydroxyprolinrigt C-terminalt domæne isoleret fra agurk peelings  (engelsk)  // FEBS Lett. : journal. - 1992. - Bd. 314 , nr. 3 . - S. 220-223 . - doi : 10.1016/0014-5793(92)81475-2 . — PMID 1468551 .
6. ↑ Oesterhelt D., Mattar S., Scharf B., Rodewald K., Engelhard M., Kent SB Den primære struktur af halocyanin, et arkæalt blåt kobberprotein, forudsiger et ankerlipid til membranfiksering  //  J. Chem.  : journal. - 1994. - Bd. 269 , nr. 21 . - P. 14939-14945 . — PMID 8195126 .
7. ↑ Yano T., Fukumori Y., Yamanaka T. Aminosyresekvensen af ​​rusticyanin isoleret fra Thiobacillus ferrooxidans  // FEBS Lett  . : journal. - 1991. - Bd. 288 , nr. 1 . - S. 159-162 . - doi : 10.1016/0014-5793(91)81025-4 . — PMID 1879547 .