Institut for Matematiske Biologiske Problemer RAS

Instituttet for matematiske problemer i biologi ved det russiske videnskabsakademi er en gren af ​​den føderale statsinstitution "Federal Research Center Institute of Applied Mathematics opkaldt efter V.I. M.V. Keldysh fra det russiske videnskabsakademi ” (forkortet: IMPB RAS - gren af ​​IPM opkaldt efter M.V. Keldysh RAS ), sådan begyndte det officielle navn på instituttet at se ud efter omorganiseringen af ​​2015-2016. [en]

Instituttets formål er at udvikle matematiske og beregningsmetoder til biologisk forskning, samt direkte at løse beregningsbiologiske problemer ved hjælp af sådanne metoder.

Instituttet udgiver det videnskabelige tidsskrift Mathematical Biology and Bioinformatics. [2]

Instituttets struktur

Instituttet omfatter [3] :

• Makromolekyle Krystallografi Laboratorium
• Laboratorium for kvantemekaniske systemer
• Laboratorium for Molekylær Dynamik
• Neurale netværkslaboratorium
• Anvendt Matematik Laboratorium
• Beregningsøkologisk laboratorium
• Institut for Avanceret Informationsteknologi
  • Databehandlingslaboratorium
  • Bioinformatik laboratorium
• Afdeling for computer- og informationsressourcer

Videnskabelig aktivitet

Videnskabelige anvisninger

• Teoretisk udvikling ;
  • teoretiske grundlag for nanobioelektronik ;
  • udvikling af spektral-analytiske metoder til behandling af data fra biologiske eksperimenter;
  • udvikling af numerisk-analytiske metoder til behandling af data fra biologiske eksperimenter;
  • analytiske løsninger af integro-differentialligninger ;
  • metoder til analyse af dynamiske systemer .

• Dataanalyse
  • analyse af menneskelig hjerneaktivitet ;
  • udvikling af metoder til vurdering af biodiversiteten i vegetationsdækket ;
  • udvikling af algoritmer og programmer til undersøgelse af genomiske sekvenser: genkendelse af kodende regioner og områder med homogenitet;
  • udvikling af computermetoder til undersøgelse af biopolymerers primære strukturer ;
  • udvikling af nye metoder til sammenligning af biopolymerer og deres anvendelse til genkendelse af typen af ​​rumlig struktur af proteiner;
  • skabelse af nye metoder til at dechifrere strukturen af ​​komplekser af biologiske makromolekyler på grundlag af data om spredning af røntgenstråler og neutroner ;
  • udvikling af metoder til fremskaffelse, bearbejdning og analyse af digitale billeder inden for biologi og medicin.

• Beregningsbiologi
  • simuleringsmodellering af dynamikken i biomolekylære systemer;
  • neurale netværksmodeller af informationsbehandling i hjernestrukturer ;
  • dyrkning af tilfældige grafer og deres anvendelser i matematisk neurovidenskab ;
  • undersøgelse af modeller af spændingsafhængige ionkanaler af exciterbare biomembraner ;
  • software til undersøgelse af cellemetabolisme ;
  • matematiske modeller i biomekanik ;
  • numerisk løsning af problemer med kardiofysik .

• Synergetik (herunder sådanne sektioner som: Dynamisk system , kaosteori , ikke- ligevægtsterodynamik , systembiologi )
  • undersøgelse af ikke-lineære modeller af selvfangede tilstande i kondenserede medier;
  • asymptotiske metoder og numerisk simulering i studiet af excitationsbølger ;
  • bifurkationer i differentialligninger, der beskriver systemer med symmetrier;
  • Bifurkationer i funktionelle differentialligninger og bifurkationshukommelsesfænomener .

• bioinformatik

• Parallel computing
  • udvikling af en højtydende computerklynge ;
  • CUDA teknologier .

Specialiserede videnskabelige projekter

• projekt "Matematisk celle" [4] ;
• projekt " Generaliseret spektral-analytisk metode " (GSAM) [5] [6] [7] .

Undervisning og sociale aktiviteter

Instituttets personale gav forelæsningskurser ved Pushchino State University [8] (PushchGU); A. M. Molchanov var arrangør af Educational Center for Mathematical Biology ved Push State University og dets dekan fra 1994 til 2005, samt leder af masteruddannelsen "Modeling af biologiske systemer" fra Push State University (1994-2011).

Siden 2006 har Instituttet en gang hvert andet år afholdt en konference "Mathematical Biology and Bioinformatics".

Historie

Instituttet blev grundlagt den 17. februar 1972 i Pushchino , og AM Molchanov blev udnævnt til direktør . Indtil 1992 blev det kaldt Research Computing Center (NICC) under USSR's Videnskabsakademi ; indtil februar 2016 blev det omtalt som Federal State Budgetary Institution of Science Institute of Mathematical Problems of Biology of the Russian Academy of Sciences ( Institute of Mathematical Problems of Biology , IMPB RAS ).

Milepæle

• 17. februar 1972 - Research Computing Center (NICC) fra USSR Academy of Sciences blev organiseret;
• 1972 - afdelingen for computerteknologi blev oprettet (leder - V. G. Erokhin );
• 1983 - afdelingen for informatik blev oprettet (leder - V. V. Kornilov ); senere omdannet til sektoren for informationssøgningssystemer (hoved - V.V. Vasilchikov ), som fungerede indtil 1989;
• 1984 - opgavestøttegruppen for afdelingen for computerteknologi blev omdannet til afdelingen for organisering af beregningsarbejde (leder - V. A. Korolev );
• 1986 - Sektoren for problemer med computerlæring blev oprettet (ledet af R. M. Borisyuk );
• 1990 - sektoren for matematiske problemer i biomekanik blev organiseret
• 1992 - NIVT'er fra USSR Academy of Sciences blev omdøbt til Institute of Mathematical Problems of Biology (IMPB) under det russiske videnskabsakademi; afdelingerne for computerteknologi og organiseringen af ​​beregningsarbejdet blev opløst;
• 1998 - Doktor i filosofi blev valgt som ny direktør for instituttet. n. V. D. Lakhno
• 2000 - Inter-Institute Department of Computing and Information Resources (MOVIR) blev oprettet
• 2004 — bioinformatiklaboratorium etableret
• 2015 - ved beslutning fra FASO blev instituttet fusioneret med Institute of Applied Mathematics [1]

Ledere

• Molchanov, Albert Makarievich (1972-1998, instruktør)
• Lakhno, Victor Dmitrievich (1998-2016, instruktør)
• Lakhno, Victor Dmitrievich (siden 2016, leder af filialen)

Bemærkelsesværdige samarbejdspartnere

• Dedus, Florenc Fyodorovich
• Molchanov, Albert Makarievich
• Shnol, Emmanuil Elevich

Links

• Officiel hjemmeside Arkiveret 28. februar 2008 på Wayback Machine
• En kort historie om instituttet Arkiveret 2. marts 2009 på Wayback Machine

Noter

1. ↑ 1 2 Bekendtgørelse om tiltrædelse af IMPB til IPM . Hentet 1. marts 2016. Arkiveret fra originalen 6. marts 2016. (ubestemt)
2. ↑ Tidsskriftets officielle hjemmeside . Hentet 10. oktober 2017. Arkiveret fra originalen 11. oktober 2017. (ubestemt)
3. ↑ Laboratorier af IMPB RAS . Hentet 3. april 2022. Arkiveret fra originalen 2. marts 2009. (ubestemt)
4. ↑ Mathematical Cell-projektets officielle hjemmeside . Dato for adgang: 30. juni 2016. Arkiveret fra originalen 11. januar 2016. (ubestemt)
5. ↑ Proc. SPIE. bind 2363. 1995. S.109-112 . Dato for adgang: 30. juni 2016. Arkiveret fra originalen 18. august 2016. (ubestemt)
6. ↑ Proc. SPIE. bind 2363. 1995. S. 113-118 . Dato for adgang: 30. juni 2016. Arkiveret fra originalen 18. august 2016. (ubestemt)
7. ↑ SBARS - Spektral-baseret tilgang til gentagelsessøgning . Hentet 26. september 2017. Arkiveret fra originalen 26. september 2017. (ubestemt)
8. ↑ Officiel hjemmeside for Pushchino University  (utilgængeligt link)