Den midlertidige regerende Junta i Panama ( spansk: Junta Provisional de Gobierno de Panamá ) var den midlertidige regering, der regerede Panama efter uafhængigheden indtil oprettelsen af en permanent regering.
Om aftenen den 3. november 1903 blev Panamas løsrivelse fra Colombia proklameret i Panama City . Efter at have hørt om, hvad der skete, indkaldte lederen af kommunalbestyrelsen i distriktet Panama, Demetrio Brid , til et åbent møde i kommunalbestyrelsen den 4. november 1903 på byens torv, hvor den midlertidige regerende Junta i Panama , bestående af bl.a. José Agustín Arango , Federico Boyd og Thomas Arias , blev valgt . En delegation fra Manuel Amador , Federico Boyd og Pablo Arosemena blev straks sendt til USA for at diskutere spørgsmål relateret til Panamakanalenved ankomsten til stedet fandt hun dog ud af, at USA netop havde indgået en tilsvarende traktat . Så blev Manuel Espinosa Batista introduceret i Juntaen , som erstattede Boyd fra 9. november til 7. december.
Den regerende Junta udnævnte ministerkabinettet:
I februar 1904 mødtes det konstitutionelle nationale konvent i Panama under ledelse af Pablo Arosemena, som valgte Manuel Amador som landets første officielle præsident.