Strukturel genomik
Strukturel genomik søger at beskrive den tredimensionelle struktur af hvert protein kodet af et givent genom. Der anvendes en kombination af eksperimentelle og modellerende tilgange. Den grundlæggende forskel mellem strukturel genomik og traditionel strukturel forudsigelse er, at strukturel genomik forsøger at bestemme strukturen af hvert protein kodet af genomet, i stedet for at fokusere på et bestemt protein. Med fulde genomsekvenser tilgængelige kan strukturforudsigelse foretages hurtigere ved hjælp af en kombination af eksperimentelle og modellerende tilgange, især fordi tilgængeligheden af et stort antal ordnede genomer og tidligere opløste proteinstrukturer gør det muligt for forskere at bygge videre på strukturerne af tidligere opløste homologer.
Da et proteins struktur er tæt forbundet med et proteins funktion, gør strukturel genomik det muligt at kende et proteins funktioner. Ud over at belyse proteinfunktioner kan strukturel genomik bruges til at identificere nye proteinfoldninger og potentielle mål for lægemiddelopdagelse.
Metoder
Strukturel genomik bruger komplette genomsekvenser på flere måder til at bestemme proteinstrukturer. Målproteinets gensekvens kan sammenlignes med en kendt sekvens, og strukturel information kan derefter udledes af strukturen af det kendte protein. Strukturel genomik kan bruge en modelleringsbaseret tilgang, der er afhængig af et match mellem et ukendt protein og en løst proteinstruktur.
Se også
Litteratur
- Chandonia JM, Brenner SE Indvirkningen af strukturel genomik: forventninger og resultater // Videnskab : tidsskrift. - 2006. - Januar ( bind 311 , nr. 5759 ). - S. 347-351 . - doi : 10.1126/science.1121018 . — PMID 16424331 .
 Ordbøger og encyklopædier |
|---|