Affinitet (biokemi)

I biokemi er affinitet (også bindingsaffinitet ) et mål for molekylers tendens til at binde sig til andre molekyler, for eksempel mellem bindingspartnere i en protein - ligand- interaktion : jo højere affinitet, jo større er associationskonstanten Ka ( også kaldet bindingskonstanten).

Karakteristika

Men på nuværende tidspunkt, i stedet for associationskonstanten, bruges det omvendte mål, dissociationskonstanten Kd , sædvanligvis : jo højere affiniteten af proteinet for dets ligand, desto lavere er dissociationskonstanten for komplekset. Om eksemplet med dannelse/spaltning af enzym-substratkomplekset [ES].

definitioner i henhold til loven om massevirkning eller kinetiske konstanter (hastighedskonstanter k) er anført her:

associationskonstant (bindingskonstant)	$K_{a}={[ES] \over [E]\cdot [S]}$	$K_{a}={k_{1} \over k'_{1))$
dissociationskonstant	$K_{d}={[E]\cdot [S] \over [ES]}$	$K_{d}={k'_{1} \over k_{1))$ .

I enzymkinetik bruges Km , Michaelis-konstanten , nogle gange som et mål for et enzyms affinitet til dets substrat. I praksis har dette en vis ret, men teoretisk skal dissociationskonstanten for ES-komplekset K d og Michaelis-konstanten nøje skelnes. Ifølge Briggs og Haldane afhænger Michaelis-konstanten også af antallet af ændringer k 2 og beregnes som følger:

K_{m}={k'_{1}+k_{2} \over k_{1))

Afledning fra K m til Kd er kun mulig, hvis . Denne antagelse er ikke egnet i alle tilfælde, men blev oprindeligt lavet af Leonor Michaelis og Maud Menten for at udlede Michaelis-Menten-ligningen . ${\displaystyle k_{2}\ll k'_{1))$

Affinitet kan bestemmes ved hjælp af et ligandbindingsassay .

Se også

Litteratur

Jeremy M. Berg, John L. Timochko, Lubert Strayer: Biokemi. 6. udgave, Spectrum Academic Publishing, Heidelberg, 2007. ISBN 978-3-8274-1800-5 .
Donald Voet, Judith G. Voet: Biokemi. 3. Edition, John Wiley & Sons, New York, 2004. ISBN 0-471-19350-X .
Bruce Alberts , Alexander Johnson, Peter Walter, Julian Lewis, Martin Ruff, Keith Roberts: The Molecular Biology of the Cell , 5. Edition, Taylor og Francis, 2007, ISBN 978-0-8153-4106-2 .