Stedspecifik rekombination

Stedspecifik rekombination  er en type genetisk rekombination , hvor der under udvekslingen af ​​DNA-strenge sker en reaktion mellem specifikke steder [1] [2] [3] . Udskiftning af DNA-segmenter sker ved at genkende og sammenkæde korte DNA-sekvenser (sites), hvor specielle enzymer spalter, omarrangerer og genforbinder DNA-strenge. For nogle rekombinationssystemer er kun rekombinaseenzymet tilstrækkeligt, mens andre kræver tilstedeværelsen af ​​yderligere faktorer. I naturen sker stedspecifik rekombination, når en virus integreres i genomet (dannelse af et provirus ).

Stedspecifikke rekombinationssystemer er meget specifikke, hurtige og effektive, selv når der arbejdes med komplekse eukaryote genomer [4] og er af denne grund meget brugt i genteknologi [5] De er involveret i mange cellulære processer, herunder bakteriel genomreplikation, patogenese, bevægelse af mobile genetiske elementer og dannelse af antistoffer i pattedyrs lymfoide celler .

Rekombinationssteder er sædvanligvis 30 til 200 nukleotider lange og består af to omvendte gentagelser, hvortil rekombinasen binder, mellem hvilke den sekvens, hvor rekombinationen finder sted, er placeret. Begge steder, hvor rekombination finder sted, er sædvanligvis identiske, men der er undtagelser (for eksempel integrationssteder for fagen λattP og attB , se lambda-fagen ) [6] .

Se også

Noter

  1. Bode, J; Schlake, T; asadasasada Iber, M; Schuebeler, D; Seibler, J; Snezhkov, E; Nikolaev, L. Transgenetikerens værktøjskasse: nye metoder til målrettet modifikation af eukaryote genomer   // Biol . Chem. : journal. - 2000. - Vol. 381 , nr. 9-10 . - s. 801-813 . - doi : 10.1515/BC.2000.103 . — PMID 11076013 .
  2. Kolb, A. F. Genome Engineering Using Site-Specific Recombinases  //  Cloning & Stem Cells: journal. - 2002. - Bd. 4 , nr. 1 . - S. 65-80 . - doi : 10.1089/153623002753632066 . — PMID 12006158 .
  3. Coates, CJ; Kaminski, JM; Summers, JB; Segal, DJ; Miller, AD; Kolb, AF Stedstyret genommodifikation: derivater af DNA-modificerende enzymer som målretningsværktøjer  //  Trends in Biotechnology : journal. - Cell Press , 2005. - Vol. 23 , nr. 8 . - S. 407-419 . - doi : 10.1016/j.tibtech.2005.06.009 . — PMID 15993503 . Arkiveret fra originalen den 29. august 2006.
  4. Sauer, B. Inducerbar genmålretning i mus ved hjælp af Cre/lox-systemet  //  Metoder: tidsskrift. - 1998. - Bd. 14 , nr. 4 . - s. 381-392 . - doi : 10.1006/meth.1998.0593 . — PMID 9608509 . Arkiveret fra originalen den 11. juni 2011.
  5. Akopian, A.; Stark, WM Stedspecifikke DNA-rekombinaser som instrumenter til genomisk kirurgi  (engelsk)  // Advances in Genetics: tidsskrift. - 2005. - Bd. Fremskridt inden for genetik . - S. 1-23 . — ISBN 978-0-12-017655-7 . - doi : 10.1016/S0065-2660(05)55001-6 .
  6. Landy A. Dynamiske, strukturelle og regulatoriske aspekter af lambda stedspecifik rekombination   // Årlig gennemgang af biokemi : journal. - 1989. - Bd. 58 , nr. 1 . - P. 913-941 . doi : 10.1146 / annurev.bi.58.070189.004405 . — PMID 2528323 .