| NAMD | |
|---|---|
| Udvikler | University of Illinois i Urbana og Champaign |
| Skrevet i | C++ |
| Operativ system | Cross platform |
| nyeste version |
|
| Internet side | ks.uiuc.edu/Research/nam… |
| Mediefiler på Wikimedia Commons | |
NAMD ( NA noscale M olecular Dynamics ) er et freeware molekylær dynamikprogram skrevet ved hjælp af Charm++ parallel programmeringsmodellen , som har høj paralleliseringseffektivitet og ofte bruges til at simulere store systemer (millioner af atomer). Programmet blev oprettet i fællesskab af Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) og Parallel Programming Laboratory (PPL) ved University of Illinois i Urbana og Champaign .
Programmet blev annonceret i 1995 af Nelson et al. [2] som et parallelt molekylært dynamikprogram inklusive interaktive simuleringer knyttet til VMD -visualiseringsprogrammet . Programmet understøtter multiprocessing , evnen til at bruge grafikprocessorer til beregninger ( CUDA -teknologi ).