N-terminal

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 28. august 2017; checks kræver 2 redigeringer .

N - Terminus ( engelsk  N-terminus ), også amino-terminus  , er aminogruppen i den første aminosyre , som et proteinmolekyle ellerpeptid begynder med [1] .

Hver aminosyre har en aminogruppe og en carboxylgruppe . Aminosyrer binder til hinanden gennem en dehydreringsreaktion ved at tilføje carboxylgruppen i en aminosyre til aminogruppen i en anden. Polypeptidkæder slutter således med en fri carboxylgruppe, C-terminalen , og begynder med en aminogruppe, N-terminalen [1] .

Metoder til bestemmelse af den N-terminale aminosyre

For at bestemme arten af ​​den N-terminale aminosyre er der foreslået en række metoder, især Sanger-metoden (F. Sanger), baseret på aryleringsreaktionen af ​​polypeptidet 2,4-dinitrofluorbenzen (DNFB), som fører til dannelsen af ​​en gulfarvet 2,4-dinitrophenylderivat N-terminal aminosyre. Polypeptidopløsningen behandles med DNFB, som interagerer med den frie NH2 - gruppe i den N-terminale aminosyre i peptidet.

Efter sur hydrolyse af reaktionsproduktet, dinitrophenylpeptid, er kun én N-terminal aminosyre bundet til reagenset i form af 2,4-dinitrophenylaminosyre (stabil ved hydrolyse). I modsætning til andre frie aminosyrer dannet under hydrolysen af ​​polypeptidet, er det gult. Det identificeres ved kromatografi.

For at bestemme den N-terminale aminosyre er phenylthiohydantoin Edman-metoden meget mere udbredt på grund af dens høje følsomhed og muligheden for flere anvendelser i den samme prøve. Phenylisothiocyanat reagerer med den frie a-NH2- gruppe i den N-terminale aminosyre i polypeptidet til dannelse af phenylthiocarbamoylpeptid.

Noter

  1. 1 2 Nelson, Cox, 2011 , s. 128.

Litteratur