KORT (domæne)

Caspase rekrutteringsdomæne

Struktur af et RAID-KORT. [en]
Identifikatorer
Symbol KORT
Pfam PF00619
Interpro IPR001315
SMART SM00114
PROSITE PS50209
SCOP 3
SUPERFAMILIE 3
CDD cd01671
Tilgængelige proteinstrukturer
Pfam strukturer
FBF RCSB FBF ; PDBe ; PDBj
PDBsum 3D model

CARD (forkortet fra engelsk  Caspase recruitment domains , eller Caspase activation and recruitment domains ) - caspase aktiverings- og rekrutteringsdomæner , er interaktionsmotiver, der findes i en lang række proteiner, normalt involveret i processer forbundet med inflammation og apoptose . Disse domæner medierer dannelsen af ​​større proteinkomplekser gennem direkte interaktioner mellem individuelle CARD-holdige proteiner. CARD-domæner findes i et bemærkelsesværdigt bredt udvalg af proteiner, herunder helicaser , kinaser , mitokondrielle proteiner, caspaser og andre cytoplasmatiske faktorer.

Nøglefunktioner

CARD-domæner er en underklasse af et proteinmotiv kendt som dødsfolden, som indeholder seks til syv antiparallelle alfa-helixer med en hydrofob kerne (kerne) og en ydre overflade bestående af ladede aminosyrerester . Andre motiver i denne klasse omfatter pyrindomæne (PYD), dødsdomæne (DD) og dødseffektordomæne (DED), som alle også primært er involveret i reguleringen af ​​apoptose og inflammatoriske responser.

Involvering i apoptose

CARD-domæner er tidligere blevet karakteriseret ved caspase-aktivering og apoptose [2] . Den grundlæggende seks-helix-struktur i regionen ser ud til at være bevaret så langt tilbage som ced-3- og ced-4- generne i C. elegans , organismen hvori flere komponenter af det apoptotiske apparat først blev beskrevet. KORT-motiver er til stede i en række proteiner, der fremmer apoptose, især pattedyr -caspaser 1,2,4,5 , 9 og 15 .

Deltagelse i inflammation

Liste over CARD-holdige proteiner

Noter

  1. Chou JJ, Matsuo H., Duan H., Wagner G. Løsningsstruktur af RAIDD CARD og model for CARD/CARD interaktion i caspase-2 og caspase-9 rekruttering  // Celle  :  journal. - Cell Press , 1998. - Juli ( vol. 94 , nr. 2 ). - S. 171-180 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81417-8 . — PMID 9695946 .
  2. Hofmann K., Bucher P., Tschopp J. CARD  - domænet: et nyt apoptotisk signalmotiv  // Trends Biochem Sci : journal. - 1997. - Bd. 22 , nr. 5 . - S. 155-156 . - doi : 10.1016/S0968-0004(97)01043-8 . — PMID 9175472 .