Endobionter (fra "endo" - inde + biont ) - organismer , der lever inde i en anden levende organismes krop. Endocytobionter er endobionter, der lever i cellerne i et andet væsen.
Nogle gange bringer endobionter mere eller mindre betydelig skade på værten, det vil sige, at de er parasitter . I andre tilfælde er de nyttige for ejeren, nogle gange kan han ikke eksistere uden dem, så kan vi tale om gensidigt gavnlig symbiose - gensidighed .
En række endobionter kan være cellulære parasitter. Interessant nok lever sådanne intracellulære parasitter i cellerne hos en lang række dyr, inklusive mennesker, mens intracellulære symbionter findes i mange hvirvelløse dyr, men indtil videre er kun nogle salamandere blevet fundet i hvirveldyr .
Mange endobionter findes ikke uden for kroppen af en fremmed organisme.