Den geobotaniske videnskabs historie kan betinget opdeles i tre perioder: præparadigmeperioden , perioden med vegetationsdiskrethedsparadigmet og den moderne periode.
Som enhver videnskab var geobotanik i præparadigmeperioden en eklektisk blanding af forskellige alternative hypoteser og konkurrerende videnskabelige fællesskaber, som hver især, med udgangspunkt i visse fakta, skaber sine egne modeller uden megen appel til nogen eksterne autoriteter.
De første, fragmentariske undersøgelser af vegetation går tilbage til det 16. - 17. århundrede. Indtil begyndelsen af det 20. århundrede blev undersøgelser af vegetationsdække udført inden for rammerne af botanisk geografi , geobotanik skilte sig ikke ud som en selvstændig videnskab, den havde ikke sit eget begrebsmæssige og terminologiske apparat. Samtidig gav undersøgelserne af den russiske videnskabsmand V. V. Dokuchaev ( 1846-1903 ) en betydelig fremdrift til systematiske undersøgelser af vegetation .
I begyndelsen af det 20. århundrede fik undersøgelser af plantesamfund et betydeligt omfang, så det blev nødvendigt at koordinere forskningen og etablere en samlet terminologi for den nye videnskab.
Geobotanikkens fødsel som videnskab anses for at være 1910 , hvor man ved den III Internationale Botaniske Kongres i Bruxelles for første gang foreslog navnet på vegetationens vigtigste syntakson (klassifikationsenhed) - associationer . Phytocenoser i denne periode blev betragtet som historisk dannede virkelige formationer med en deterministisk struktur, mere eller mindre adskilt fra hinanden. Denne tilgang var baseret på analogien af plantesamfundet og organismen, så dette paradigme blev også kaldt organismisme . Forskere var under indflydelse af at "præge" (Meyen, 1977) de mønstre, der blev afsløret i studiet af organismer, og forsøgte ubevidst at se individer, der ligner planter og typologiske enheder, der ligner plantearter på det fytokoenotiske niveau af vegetationsorganisation.
Det var denne tilgang, der blev brugt af datidens største og mest autoritative geobotanikere - F. Clements og V. N. Sukachev.
Begyndelsen af den moderne periode i geobotanikkens historie anses for at være midten af det 20. århundrede, hvor forståelsen af vegetationsdække som et sæt af diskrete phytocenoser blev erstattet af begrebet vegetationsdække som et kontinuum . betragter phytocenoser som konventioner, kunstigt isoleret fra plantekontinuummet. Det begyndte at fortrænge begrebet diskrethed fra 1950'erne. Dette koncept er baseret på den individualistiske hypotese, først formuleret af den russiske videnskabsmand L. G. Ramensky i 1910 . Essensen af denne hypotese er, at hver art er specifik i sit forhold til det ydre miljø og har en økologisk amplitude , der ikke helt falder sammen med andre arters amplituder (det vil sige, at hver art er fordelt "individualistisk"). Hvert samfund er dannet af arter, hvis økologiske amplituder overlapper under givne miljøforhold. Når en eller anden faktor eller gruppe af faktorer ændrer sig, falder velstanden gradvist og nogle arter forsvinder, andre arter dukker op og øger velstanden, og på den måde sker overgangen fra en type plantesamfund til en anden. På grund af specificiteten (individualiteten) af artens økologiske amplituder sker disse ændringer ikke synkront, og med en gradvis ændring i miljøet ændres vegetationen også gradvist. Derfor er det umuligt at udskille objektivt eksisterende fællesskaber med en deterministisk struktur og dynamik.
Synspunkter fra Ramensky og en række udenlandske videnskabsmænd, der fremsatte lignende ideer, blev først forstået og accepteret i det geobotaniske samfund i 1950'erne. Dette skyldes både det videnskabelige samfunds uforberedelse til at acceptere kontinualisters innovative ideer og den kolossale prestige hos forskere, der holder sig til organismistiske holdninger.
"Reanimationen" af de første kontinualisters ideer fandt sted i 1950'erne og 1960'erne. I USSR begyndte systematisk forskning baseret på det kontinualistiske paradigme i begyndelsen af 1970'erne, primært gennem indsatsen fra V. I. Vasilevich, V. D. Aleksandrova og B. M. Mirkin.
På nuværende tidspunkt er synet på vegetationsdækket som et kontinuum fremherskende næsten overalt, men det menes, at graden af kontinuum under forskellige økologiske forhold kan være forskellig: det øges i stepperne, i forhold på enge, ruderale samfund, tundra , osv. og fald i boreale, subboreale og subtropiske skove.