Iset-kosakker er efterkommere af kosakkerne fra hæren af Yermak Timofeevich , som slog sig ned i området ved Iset -floden (for eksempel kosak-høvdingene Davyd Andreev og Belosheikin) og i 1649, efter ordre fra Tobolsk , grundlagde det første fængsel her - Krasny Bor ; derefter blev bygderne Ust-Miasssky , Isetsky, Kolchedansky (1650) og andre grundlagt ; indtil 1688 blev yderligere 15 nye byer født. De der. for i år er det allerede værd at anerkende eksistensen af Iset-kosakkerne, som indtil 1738 beholdt deres kosak-selvstyre og fællesliv.
I det 18. århundrede blev bosættelsen af Zakamsk-territoriet udført særligt energisk, og i 1735 , under Rumyantsevs felttog med kosakkerne for at undertrykke bashkirernes indignation, blev Orenburg-fæstningen (ved Ori -flodens munding ) grundlagt af chefsekretær Kirillov, året efter blev det 2. felttog gennemført til Sakmara-byen, og flere befæstninger blev bygget både i denne retning og nord for Orenburg , fra siden af Sibirien. Efterfølgerne til Kirillov, Tatishchev og Neplyuev omringede hele Basjkirien med en ring af befæstede byer, og i 1738 blev denne region delt i 2 provinser: Iset og Ufa ; byen Orenburg blev flyttet til Krasnaya Gora, og fæstningen blev forladt, men omdøbt til Orsk-fæstningen . Da kosakkerne blev betragtet som det bedst egnede element til koloniseringen af regionen, var alle regeringens bekymringer rettet mod at øge deres antal og organisere dem. På dette tidspunkt blev en særlig Iset Kosakhær dannet af dem, der boede i Iset-provinsen ; de fik også følgeskab af immigranter fra de indre provinser, som slog sig ned her.
Samtidig med grundlæggelsen af fæstninger i Orenburg-territoriet holdt Neplyuev ikke op med at tage sig af den stabile struktur af kosakbefolkningen i det, og anerkendte ham som den mest i stand til at bevogte grænselinjerne. På grundlag af de højeste dekreter blev Iset-kosakkerne adskilt fra det sibiriske departement og overført til Orenburg-afdelingen. Ved kraft af dekretet fra 1736 blev folk fra de "tidligere tjenester" samlet fra de tidligere grænselinjer og sendt til Orenburg-territoriet.
I 1748 blev Iset-kosakkerne ifølge Neplyuevs projekt en del af Orenburg Corps, der befolkede fæstningerne Chelyabinsk, Miass, Chebarkul og andre (1.380 mennesker). En del af kosakkerne tjente uden løn, og derfor blev kosakkerne opdelt i lønnede, lavtlønnede og ukompenserede; Iset-kosakker tilhørte også denne sidste kategori, som kun blev sendt til ekstern tjeneste i nødstilfælde og kun i dette tilfælde fik løn, men de måtte forsørge sig med jord, der blev tildelt dem samtidig med opførelsen af de fæstninger, hvor de blev lokaliseret. Pugachev-oprøret og kirghizernes razziaer forstyrrede i høj grad kosakkernes tjeneste; derfor, i 1798, efter forslag fra Orenburg-guvernøren, baron Igelstrom , blev strukturen og tjenesteordenen for Orenburg-kosakkerne , herunder Iset-kosakkerne, etableret, og Iset-hærens land udgjorde en af de 5 Orenburg-kantoner. , i spidsen for hvilken blev sat Iset-hærens militære ataman. Holdene samlet af kantoncheferne kom på afstand under særlige marchkommandørers jurisdiktion; Kosakker blev indkaldt til tjeneste i en alder af 20 til 50 år og var med deres våben og heste, men ingen uniformer blev installeret. Omkostningerne ved at udstyre kosakkerne, der blev sendt til den lineære tjeneste, blev tilskrevet midlerne fra stanitsa- og yurt-samfundene, hvis medlemmer var underlagt en særlig monetær afgift. I 1790 blev Orenburg-kosakkerne , og blandt dem Iset-kosakkerne, først rekrutteret til at deltage i krige med vesteuropæiske stater (Sverige).
I 1803 fusionerede Iset-kosakkerne endelig med Orenburg -kosakkerne , som blev reformeret sammen med Ural- og Sortehavskosakkerne .