Et ionmikroskop er et mikroskop , hvor en ionstråle genereret af en kilde bruges til at opnå et billede .
Ifølge driftsprincippet ligner et ionmikroskop et elektronmikroskop - en ionstråle, der har passeret gennem det undersøgte objekt, fokuseres af et system af elektrostatiske eller magnetiske linser og giver et forstørret billede af objektet på skærmen, dette billede kan fotograferes. Fordele: højere opløsning - på grund af det faktum, at de Broglie-bølgelængden for ioner er meget mindre end for elektroner , er diffraktionseffekter meget små i et ionmikroskop , hvilket begrænser opløsningen af mikroskopet, mindre indflydelse af ændringer i ionmassen ved høje accelererende spændinger, bedre billedkontrast. Samtidig har ionmikroskopet ulemper - et mærkbart tab af ionenergi, når det passerer gennem selv meget tynde genstande, hvilket forårsager ødelæggelse af objekter, svag fotografisk handling, stor kromatisk aberration , ødelæggelse af skærmens fosfor af ioner.
Et ionmikroskop uden linser viste sig at være mere effektivt - en ionprojektor .