Substrat (fra lat. substrat - base, kuld) - i biologi , habitat og udvikling af organismer . Substrater tjener som et vedhæftningssted for et dyr, en plante eller en anden organisme og kan fungere som yngleplads .
Substratet kan omfatte både levende og ikke-levende materialer såvel som dyr. En organisme, der lever på et substrat, kan til gengæld være et substrat for en anden organisme. For eksempel er en sten et substrat for alger , og alger er et substrat for dyr, der lever på den.