Herbarium of Moscow University ( MSU Herbarium ) | |
---|---|
| |
internationalt navn | MW |
Grundlagt | 1765 |
Direktør | ledig |
Medarbejdere | 7 |
Beliggenhed | Rusland : Moskva, Leninskiye Gory, 1, bygning 12, værelser 401 og 501 |
Internet side | plant.depo.msu.ru |
Priser | Free Knowledge Wiki Award (2018) |
Mediefiler på Wikimedia Commons |
Herbarium fra Moskva Universitet (også - Syreyshchikov Herbarium ) er det ældste og næststørste herbarium i Rusland . Formentlig opstået omkring 1765. Det er en strukturel underafdeling af Institut for Geobotanik , Det Biologiske Fakultet, Moscow State University .
Mængden af anlægsaktiver er 1.030.669 prøver (pr. november 2017) [1] , stigningen i midler i 2016 er 22.013 prøver. Den har det internationale akronym MW. Herbariets vigtigste midler indeholder prøver, der tilhører 37.100 arter af karplanter og 2223 arter af moser [1] .
Det er på en 62. plads i form af midler blandt alle herbarier i verden , på en 24. plads blandt universitetsherbarier.
Herbariet indeholder de vigtigste samlinger om floraen i det centrale Rusland, vigtige samlinger om floraen i andre regioner i Rusland , Kaukasus , Centralasien , Kasakhstan , Mongoliet samt moser i Rusland; vigtige navnesamlinger (af Georg Hoffmann , Friedrich Ehrhart , Carl Trinius , fader og søn til Forsters, og samlinger relateret til Carl Linnaeus ).
Herbariet havde ved udgangen af 2015 seks ansatte og op til 15 freelanceassistenter [2] . I begyndelsen af det 21. århundrede blev herbariet besøgt af mere end 50 besøgende om året [2] .
I 2015 - 2017 inden for rammerne af Moskva Universitets projekt om oprettelse af en national depositarbank for levende systemer blev en komplet digitalisering (scanning, oprettelse af en database) af Herbarium-midlerne udført. Ved udgangen af 2017 blev scanninger af 911 tusinde prøver scannet og offentliggjort på internettet [3] .
Mange botanikere og naturforskere donerede deres samlinger til Herbarium of Moscow State University. Først og fremmest er de ansatte og professorer ved Moskva Universitet, dets kandidater, såvel som fremtrædende videnskabsmænd, der sendte dubletter af deres samlinger fra andre institutioner. De vigtigste samlere af Herbarium of Moscow University, som der er artikler om på Wikipedia, er anført nedenfor i alfabetisk rækkefølge:
Baseret på størrelsen og den videnskabelige aktivitet af et bestemt herbarium tildeles de ret til et vist antal stemmer ved Nomenklatursektionen af Den Internationale Botaniske Kongres . Formålet med møderne i nomenklatursektionen er at indføre aktuelle ændringer af den internationale nomenklaturkodeks for alger, svampe og planter . Ved kongressen i Shenzhen (juli 2017) blev 24 ud af 926 stemmer tildelt russiske herbarier, inkl. tre stemmer til herbariet ved Moscow State University [3] . Det er én stemme mere end i 2011.
Tidligere, i slutningen af 1990'erne - begyndelsen af 2000'erne. Med støtte fra den russiske fond for grundforskning (bevilling nr. 98-07-91048e) blev omkring 600 billeder af MSU-herbarietyper scannet og lagt på internettet ( http://herba.msu.ru/pictures/mw_type/ index.html ). Derudover blev 63 eksemplarer publiceret på Herbarium Linnaeanum CD'en. Siden da har digitaliseringsarbejdet ikke modtaget særlige midler og er blevet indstillet.
Inden for rammerne af det omfattende program "Scientific Foundations for the Creation of the National Depository of Living Systems" (bevilling fra den russiske videnskabsfond nr. 14-50-00029) i retningen "Planter" modtog herbariet ved Moscow State University midler til digitalisering af samlinger. Herbarieteamet satte sig for at digitalisere og præsentere omkring 1 million eksemplarer fra Moscow State University Herbariums samlinger på internettet inden for tre år. Ifølge prioriteterne fra Russian Science Foundation (Arctic, Fjernøsten) blev afdelingerne i Sibirien - Fjernøsten og Østeuropa valgt som pilotobjekter til digitalisering af samlinger i 2015. I 2005 opsummerede personalet resultaterne af opgørelsen af Herbarium-midlerne, som tog mere end 10 år. I de efterfølgende år blev tabeldatabasen opdateret årligt under hensyntagen til nye optagelser og omdefineringer. Inden arbejdet med digitalisering påbegyndtes, blev der arbejdet med at verificere indholdet af databasen om karplanter [84] .
Hver af prøverne før scanning gennemgik adskillige procedurer, der var nødvendige for at opnå informative billeder. Hvert ark var mærket med en international standardstregkode med en unik prøveidentifikator. Derefter blev en etiket åbnet for hver prøve (hvis den var lukket af en plante eller foldet), vigtige knækkede fragmenter af planter blev fastgjort til prøven, tilstedeværelsen af etiketter med tilsidesættelser, og rækkefølgen af stammaterialet blev kontrolleret. I sjældne tilfælde var det nødvendigt at udskifte faldefærdige omslag, rette indekser, placere prøver i små størrelser på standardark monteringspapir og kontrollere nomenklaturen igen. I alt deltog 65 personer i dette arbejde (sammen med assistenter).
Scanning af samlingen blev udført af partnervirksomheden. Denne proces blev udført i henhold til referencebetingelserne med følgende grundlæggende billedparametre. Hovedbillede: TIFF-format, 300 dpi; filstørrelse op til 60 MB; array over 30TB. Kopi: JPG-format, 300 dpi; kompression 80%; filstørrelse op til 2,5 MB; et array på omkring 1,5 TB. Bearbejdningstrin inkluderet: 90 graders rotation, sort boksbeskæring, retvinklet rotation, stregkodegenkendelse, JPG-kopioprettelse [85] .
Den videnskabelige gruppe udførte udstedelsen af materialet til scanning, satte prøverne tilbage i dækslerne, kontrollerede fuldstændigheden, vendte tilbage til stederne for permanent opbevaring. Derudover blev der om nødvendigt udført uplanlagt arbejde: kontrol af kvaliteten af billeder efter kalibrering af scannerne; søgning og udstedelse af prøver scannet med et fysisk ægteskab; søg efter prøver med manglende stregkoder; søge efter manglende prøver; kontrol af lister over mapper, der ikke var i databasen; tjek for duplikerede filer.
Oprettet i 2015, indsamlingen af billeder af scannede herbarieprøver fra midlerne fra Moscow State University herbarium omfattede scanninger af 502.000 prøver, hvoraf 156.000 var fra Sibirien-Fjernøsten-afdelingen og 346.000 fra Østeuropa-afdelingen [86] .
I 2016 blev afdelinger i Kaukasus, Krim, Mongoliet, Udenlandsk Asien, Herbarium Alchemillarum og typeprøver (ca. 215.000 prøver) samt etiketter fra konvolutter af mosherbariet (73 tusinde prøver) scannet [87] .
I 2017 blev afdelinger i Centralasien og Kasakhstan (96.000 prøver), Amerika (12.000 prøver) samt etiketter fra konvolutter fra leverurt-herbarium (4.000 prøver) og nye indeslutninger scannet [88] .
I 2018 blev sektioner af Vesteuropa (40.000 prøver), Australien og Oceanien (3.300 prøver) samt nye inklusioner scannet. I begyndelsen af november 2018 var digitaliseringen af samlingen fuldt gennemført [89] .
Som følge af digitaliseringen af midlerne i 2015-2017. Mængden af det digitale herbarium fra Moscow State University beløb sig pr. 1. januar 2018 til 911 tusind prøver [90] . Ifølge resultaterne af projektets tre år rangerer Herbarium of Moscow State University på en ottendeplads i verden med hensyn til mængden af digitaliserede og publicerede samlinger på Internettet (eftergivelig for herbaria P, L, NY, PE, US, BR, MEXU) [91] . Det har de største digitaliserede samlinger af floraen i Rusland, Ukraine, Hviderusland, Moldova, Kasakhstan, Letland, staterne Transkaukasien (undtagen Armenien), Mongoliet, Kasakhstan og fire republikker i Centralasien [92] . Derudover er det det næststørste adgangspunkt for digitaliserede herbarieprøver fra Armenien, Litauen, Nordkorea, Mali og det tredjestørste for Cypern og Vietnam.
Offentliggørelsen af scannede prøver udføres gennem den tosprogede portal for National Depository of Living Systems (både offentlige [93] og operationelle [94] versioner er tilgængelige). Fra 1. januar 2018 indeholdt portalen scannede billeder af 910.820 herbarieprøver tilhørende 35.615 arter af karplanter og mosser [95] .
Der arbejdes på at fylde Digital Herbarium fra Moscow State University med komplette metadata af scannede prøver, som inkluderer teksten på de originale etiketter og de geografiske koordinater for de steder, hvor hver prøve blev indsamlet. Dette arbejde udføres med inddragelse af frivillige [96] . Fra den 7. november 2018 er georeferencer tilgængelige for 288.751 prøver, for 122.906 prøver er den fulde etikettekst blevet indtastet i databasen, og for yderligere 339.396 prøver genkendes individuelle etiketelementer automatisk ved hjælp af OCR [97] . Siden oktober 2017 er georeference af prøver blevet udført ved hjælp af det udviklede system "ISTRA" (Intelligent System of Toponymic Recognition and Attribution), som automatisk forbinder planteprøver til et geografisk punkt [98] .
The Digital Herbarium of Moscow State University er den største donor af information om biodiversitet i Rusland til Global Biodiversity Information Facility (GBIF) [99] , en international platform-aggregator af geografiske biologiske data. Information om herbarieprøver fra Moskva Universitet tegner sig for 65% af de samlede elektroniske data offentliggjort på GBIF af russiske institutioner, og 23% af alle data om russisk biodiversitet tilgængelig på GBIF [100] , [101] .
På iNaturalist-platformen organiserede medarbejdere ved Herbarium of Moscow State University indsamlingen af data om Ruslands flora baseret på principperne om "civilvidenskab" [102] . Dette er Flora of Russia-projektet . Enhver bruger kan uploade et foto af en plante og markere skydestedet på kortet. Når definitionen er blevet valideret, tildeles dataene et "forskningsniveau" og eksporteres også til GBIF. Projektet blev lanceret i midten af januar 2019 som en konkurrence mellem regionale teams [103] . I den første måned tiltrak den mere end tusind deltagere, og antallet af uploadede observationer oversteg 30.000 [104] .
I slutningen af oktober 2019 var der allerede mere end 200 tusind billeder lagt ud på Flora of Russia, postet af 3670 deltagere [4] .
Cirka en femtedel af billederne på Flora of Russia forbliver under en proprietær licens. I december 2019 var der 225.885 billeder under en gratis licens fra 3.832 personer, mens 45.722 billeder (20,2% af de samlede uploads) fra 2.258 brugere forblev under ikke-frie licenser [5] .
Platformen har indbygget automatisk plantegenkendelse baseret på et neuralt netværk. Hvert uploadet billede, efter at have kontrolleret definitionen af eksperter, bruges til at træne systemet, som sammen med rumlige data om fordelingen af planter tillader forbedring af algoritmer til maskindetektering [105] .
Moscow Universitys Herbarium er åbent for professionelle botanikere , der udfører videnskabelig forskning fra mandag til fredag fra kl. 9 til 17 uden forudgående varsel. Herbariet er placeret i Moscow State Universitys biologi- og jordbygning i lokaler 401 og 501. Herbariets medarbejdere arrangerer efter forudgående aftale studieture for ikke-professionelle besøgende [1] .
Leder af Herbariet i 2017 - Tilsvarende medlem af det russiske videnskabsakademi , hædret professor ved Moskvas statsuniversitet , doktor i biologiske videnskaber Vadim Nikolaevich Pavlov [1] .
Herbariet tiltrækker konstant frivillige med indledende viden inden for botanik [106] , [107] .
Siden sommeren 2017 er et konkurrencedygtigt program med tre-seks måneders praktikophold for kandidatstuderende fra russiske organisationer blevet åbnet på Herbarium of Moscow State University [108] , [109] . I efteråret 2017 blev der åbnet et program med gratis praktikophold under mentorprogrammet for studerende fra de naturlige fakulteter ved Moskva-universiteterne [110]